近未来。
荒廃した関東地区。
悪の組織「豹の⽖ （パンサークロー）」により都庁は破壊され、首都機能は地方に移行していた。
府中Dブロックにある、聖チャペル女学園。
選ばれた女子生徒にしか入学できないお嬢様学校だった。
その特別科に転校してきた、如月ハニー。

ある日、学園が謎の怪人に襲われる。
するとクラスメートの何人かが、突如変身し「新世代ハニー」となり怪人と戦い始めた・・・！
驚くハニー。
その時、ハニーの耳に亡き母親の声が聞こえる。
「あなたはキューティーハニー なのよ」
如月ハニーは無意識に叫んでいた。
「ハニーフラッシュ！」
如月ハニーはキューティーハニーに変身し、怪人を倒し、気を失う・・・！

目覚めたハニーの前に姿を見せたのは、パンサークロー対策本部の早見蒼だった・・・。

早見が語った真実とは・・・？

聖チャペル女学園の真実の姿は・・・？
ハニーはなぜ記憶をリセットされたのか・・・？
「新世代ハニー」の能力とは・・・？
そして現れた「ブラックハニー」とは・・・？

アニメ、漫画、映画、様々なメディアで語られたキューティーハニーが、遂に舞台化。
原作をモチーフに、新たなハニーが令和に蘇る！

キューティーハニーの「エモい」新たな物語。